提供「生物物理實驗數據分析」、「蛋白質結構電腦模擬」與「蛋白質結構資料視覺化」三類軟體供使用者操作使用。
提供蛋白質結構分析軟體於台灣衫一號及二號之CPU與GPU計算效能參考。
提供「數據分析」、「模擬分析」、「結構生物資訊」、「視覺化應用」項目，協助跨領域合作與客製化分析。
提供小分子與蛋白質計算分析常用線上工具與資料庫連結。
蛋白質冷凍電子顯微鏡影像可透過RELION或cryoSPARC進行影像分群、三維影像重建與優化。
蛋白質分子動力學模擬軌跡可透過Blender之Pyrite插件，轉換製作成高品質科學動畫。
蛋白質結構與功能分析並非單一軟體可完成。本平台除具備軟硬體環境提供專業領域研究學者 使用，也和中研院、北醫、陽明、清大、中興、成大、中山、高醫等學研單位共同合作，協助包括 DNA擬態蛋白、膜蛋白、紅血球疾病與神經退化等多項主題研發。
本平台亦協助學研單位教育訓練與工作坊舉辦，如協助中研院在菲律賓大學 之結構生物學課程軟體教學與實作；協助中研院執行國科會科國處科普產學製播 計畫，以阿茲海默症藥物研發為主題，製作3D動畫科普影集；協助學界製作病毒 膜融合3D模型與動畫模擬等。
