最後更新時間:2022-09-21 09:18

常見問題FAQ
  • 計算叢集 (Computational Cluster)
  • 前端伺服器 (Front-end servers )
  • 高速儲存系統
    • 以上三種要素透過乙太網路與Mellanox InfiniBand HDR100高速網路相互串聯。
  • 台灣杉三號(生醫專區)共有51個計算節點，可細分為以下類別：
      • 一般節點：共計39台，每台包含CPU 56核心，128G記憶體
      較大節點：共計6台，每台包含CPU 56核心，384G記憶體
      超大記憶節點：共計4台，CPU 核心數分別為32, 72, 112, 112，對應記憶體大小為2, 4, 6, 6 TB
      GPU 節點：共計2台，每台包含CPU 56核心，768G記憶體，8張NVIDIA V100 GPU
  • 下表為您在台灣杉三號(生醫專區)可用的高速儲存系統資源。掛載為GPFS檔案系統，可透過高速Infiniband網路從所有前端伺服器與運算節點進入使用。
  • 家目錄區域
      • 家目錄空間可儲存私人檔案
      可於此編輯程式、執行與管理計算工作 (job)
      每位使用者皆有預設100GB的空間額度可使用
  • 暫存工作區域
      • 每個帳號在/work及/staging/biology磁碟下皆預設有1.5T及10T的免費空間額度
      此空間係設計給計算工作儲存而非長期儲存用
      本系統無對暫存工作區域的資料進行備份，請您自行備份資料
      因資料無法復原(含因系統當機或硬體故障而損失的資料)，請定期備份您重要的資料
      /work空間將定期執行自動清除的工作，在28天內，未存取的檔案將被清除
  • 台灣杉三號(生醫專區)的登入節點為核心設施計畫專用：
      • 203.145.216.54    (t3-c4.nchc.org.tw)
  • 使用者僅可透過上述登入節點派送工作至生醫專區計算節點
  • 用戶的資料不是儲存在登入節點的磁碟上，而是統一存放掛載於各節點上的高速儲存系統
  • /work與/home空間與台灣杉三號通用登入節點及一般計算節點均有掛載
  • 而/staging空間僅掛載於台灣杉三號生醫專區
  • 提交/管理 HPC job
  • 有全權存取高速儲存系統上的檔案
  • 編譯 HPC 相關應用程式
  • 運行除錯程式以改善程式碼
    • 計算節點與登入節點擁有相似的技術規格，因此這兩種節點擁有相容的環境，提供開發與測試應用
  • 請先確認主機帳號是否錯誤
  • 若非主機帳號錯誤，則為主機帳號之密碼或OPT碼錯誤造成
  • 請依照您取得OTP碼的方式，先確認您的PC或手機有做系統時間的校時動作(時區：GMT+8標準時間)，以免因為時間偏差，造成OTP認證碼取得錯誤，而無法登入主機。
  • 若系統時間無誤，請先嘗試變更主機帳號之密碼後，再次登入主機，如仍是出現 Access denied 訊息，則請提供相關資訊給客服人員進行處理。
  • 請用以下指令查詢磁碟空間已使用的容量與限制：
      • [查詢work、home 空間]
      指令 $ /usr/lpp/mmfs/bin/mmlsquota -u $USER --block-size auto fs01 fs02
      [查詢 /staging/biology 空間]
      指令 $ /usr/lpp/mmfs/bin/mmlsquota -u $USER --block-size auto 5Kstaging:biology
      [查詢 /staging/reserve 空間]
      指令 $ /usr/lpp/mmfs/bin/mmlsquota -j $Fileset --block-size auto 5Kstaging
      $Fileset請輸入您的在/staging/reserve/$Fileset目錄名稱
  • 登入台灣杉三號需使用「主機帳號」、「主機密碼」 ＋ 「OTP 認證碼」，若忘記設定的主機帳號，查詢的方式如下：
  • Step 1. 登入 iService 後，點入「會員中心」 ＞ 「主機帳號資訊」
  • Step 2. 便可找到主機帳號
  • 若忘記台灣杉三號的登入密碼，系統不提供查詢服務，請您直接透過系統，修改主機密碼，修改方式如下：
  • Step 1. 登入 iService 後，點入「會員中心」＞「主機帳號資訊」
  • Step 2. 點入「修改主機密碼」，便可收取手機簡訊認證碼，並重建新主機密碼
  • OTP (One Time Password) 認證碼為一次性密碼，又稱為動態密碼。 相對於長期使用相同的靜態密碼，動態密碼雖然取得較為麻煩，但保護性較高，不容易被入侵。 因此登入台灣杉三號選用主機密碼搭配 OTP 的高度安全方式，30秒更新一次，保障用戶權益。
  • Step 1. 登入 iService 後，點入「會員中心」 > 「主機帳號資訊」
  • Step 2. 點入右側 OTP 認證碼「顯示」鈕
  • 即可查看 OTP 認證碼 (30秒更新一次)
  • 台灣杉三號計算服務均採用ssh方式連線，連線至台灣杉三號的檔案傳輸可透過scp方式進行
  • 巨量資料儲存服務可使用S3通訊協定的ssl加密連線或是IBM Aspera(Aspera CLI指令ascp或是Aspera Desktop Client)進行加密傳輸
  • 當您在國網中心HPC系統想要加密您的資料時，可以在命令列下使用以下指令:
    1. 壓縮並加密
      tar -czvf - your_file_or_your_directory | openssl aes-256-cbc -pbkdf2 -salt -k password -e -out /path/to/file.tar.gz
    2. 解密並解壓縮
      openssl aes-256-cbc -pbkdf2 -salt -k password -d -in /path/to/file.tar.gz | tar xzf -
  • 巨量資料儲存服務可使用IBM Aspera(Aspera CLI指令ascp或是Aspera Desktop Client)來加解密上傳後的檔案，相關使用說明請參考 Client-Side Encryption-at-Rest (EAR)