Service Details

臺灣杉1號(Taiwania1)主機使用方式
功能 Host or IP port 連線方式 儲存空間 帳號密碼 OTP登入
登入節點：
clogin4		 140.110.148.14 22 SSH指令、PuTTY等 /work1 /home /project 同clogin4 YES
資料傳輸節點：
xdata1		 140.110.148.21 22 SFTP指令、FileZilla等FTP軟體 /work1 /home /project 同clogin4 YES
資料傳輸節點：
xdata2		 140.110.148.22 22 SFTP指令、FileZilla等FTP軟體 /work1 /home /project 同clogin4 YES
Aspera超高速傳輸節點：
aspera01		 ascp.nchc.org.tw (140.110.141.75) 22 Aspera Client: 圖形或純文字介面 Ceph S3 cloud 同clogin4 NO
S3 cloud s3-cloud.nchc.org.tw - S3 Browser、s3fs指令 Ceph S3 cloud 使用另外一組access key登入 NO
生醫軟體安裝位置 : /pkg/biology/軟體名稱/軟體名稱_v版本號
例如：
ABySS: /pkg/biology/ABySS/ABySS_v2.1.5
ClinEff: /pkg/biology/ClinEff/ClinEff_v1.0h
程式執行方式
操作步驟:

【Step 1】
透過ssh登入主機
【Step 2】
輸入密碼+OTP
【Step 3】
進入軟體安裝位置
【Step 4】
檢查是否有env.sh檔案存在
4.1. 無 → 忽略，進入第5步
4.2. 有 → 執行指令"source env.sh"，進入Step 5
【Step 5】
找出執行檔，檢查是否有bin資料夾
5.1. 如無，則執行檔在目前資料夾底下
5.2. 如有，則執行檔在bin底下，執行"cd bin"
【Step 6】
執行"ls -l"，列出所有檔案
【Step 7】
依檔案類型有不同執行方式

範例：

VarScan.jar: 執行java -jar VarScan.jar
reform.py: 執行 python reform.py
Job送出 | 資料傳輸節點 | S3儲存空間
-- 使用說明 --
Job送出方式 #1：
編寫Script檔
(Click)
Job送出方式 #2：
指令直接送出
(Click)
資料傳輸節點方式：
資料傳輸專用(上傳/下載)
(Click)
 
S3儲存空間使用 #1：
透過S3 Browser (GUI界面)
(Click)
S3儲存空間使用 #2：
透過Aspera client (GUI界面)
(Click)
S3儲存空間使用 #3：
透過Aspera cli (文字界面)
(Click)