LIONS

Life science Informatics ON-cloud Services

國網生科雲


次世代定序

次世代基因序列分析平台 目標為提供使用者基礎設施與分析平台為主的生物資訊服務,涵蓋生醫巨量資料分析所需要的大記憶體以及平行計算設備、結合定序後產生大型檔案傳輸與儲存計算所需要的高速平行化檔案系統、同時提供異地備份設施服務以保存重要的定序資料,以滿足生物學者之需求;另外根據國內外最新的生物資訊發展,也提供各式分析軟體平台或客製化服務,與舉辦相關教育訓練課程。藉由上述服務,串聯平台服務內上下游的使用者,營造發展生命科學與個人化醫學產業之必要資訊環境。

NGS

蛋白質結構

提供 蛋白質結構研發合作服務 ,進行包括蛋白質晶體結構解析、DNA擬態蛋白應用、膜蛋白模型預測、結構生物資訊分析、軟體自動化與藥物開發科普傳播等多項主題,並協助提供如X光結晶學、X光小角度散射、低溫電子顯微鏡學、分子動力學模擬、分子模型預測、分子對接與虛擬藥物篩選等常用蛋白質3D結構計算分析軟體供用戶使用。分子3D動畫特效模擬與製作則在本中心算圖農場設施進行。現有軟體清單與效能測試詳見 附表

Protein

組織切片

醫學影像病理標註雲端平台iSlide,可檢視數位病理切片影像,並能在極短暫的時間內預覽全像圖乃至細胞層次。在科學突破方面,支持各大廠牌數位病理切片影像格式和設備。平台建置於可擴展的雲存儲與高性能和高安全性的伺服器。可讓研究人員輕鬆進行協作和共享診斷註釋。其註解模組採用細緻化貝茲曲線區塊儲存診斷註釋,並以標準化XML和JSON格式呈現。API介面上預留標準化輸入/輸出接口,可用於病理診斷深度學習分析開發應用。另外產業應用方面,可用於醫學病理影像檢測相關產品,並能輕易的與現有病理學檢測標準步驟結合,提升臨床資訊與AI技術與資料結合的機會。

Histopathology

腦神經影像

2011年國家高速網路與計算中心(NCHC)與國立清華大學腦科學研究中心(BRC),共同領先國際發表全球第一個3D數位化果蠅腦神經網路圖譜 FlyCircuit ,獲國際媒體The New York Times譽為破解人腦奧秘的第一步,諾貝爾獎得主華生(James Watson)認為臺灣有機會因為擁有第一個完整的神經網路地圖而贏得國際腦科學競爭。2016年NCHC、BRC與中央研究院物理所形成跨領域合作團隊完成的同步輻射X-ray全果蠅造影技術及多尺度影像大資料庫,受到Nature專文報導。國家高速網路與計算中心(NCHC)從創新技術與儀器的建構、大規模顯微影像的系統性工作、Exabyte等級的大資料庫建立與分析、腦神經網路AI析與功能模擬、到仿腦運作的創新AI,並維持與國際競爭力。

X-Brain

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